Aby byly vaše soubory v bezpečí, je důležité obsah vašeho Macu mini pravidelně zálohovat. Nejsnazší způsob zálohování nabízí Time Machine – služba vestavěná do Macu, která umožňuje zálohovat aplikace, účty, předvolby, hudbu, fotky, filmy a dokumenty (nezálohuje však samotný operační systém macOS). Zálohy Time Machine je možné ukládat na externí úložné zařízení připojené k Macu mini nebo do podporovaného síťového svazku. Seznam zařízení podporovaných službou Time Machine najdete v článku podpory Apple Co dělat, než svůj Mac prodáte, darujete nebo použijete k nákupu na protiúčet.