Mac mini pruža sljedeće sigurnosne značajke za zaštitu onog što je na vašem računalu te za sprječavanje učitavanja neautoriziranih softverskih aplikacija tijekom pokretanja:
Sigurna pohrana: Disk za pohranu na Mac mini računalu kriptiran je hardverskim ključevima koji su povezani s njegovim hardverom radi pružanja naprednih razina sigurnosti. Obnavljanje podataka možda neće biti moguće u slučaju katastrofalnog zakazivanja tako da sigurnosnu kopiju svojih datoteka trebate izraditi na vanjskom izvoru. Pogledajte članak Apple podrške O sigurnosnom podizanju sustava.
Ako se Mac mini ne može pokrenuti jer je detektirao nepouzdanu komponentu, pokrenut će se sa sigurne particije za obnavljanje i automatski ispraviti greške ako je moguće. Za dodatne informacije o Uslužnom programu za sigurno podizanje sustava ili informacije o podešavanju ostalih opcija kao što su podizanje s eksternog uređaja pogledajte članak Apple podrške O Apple T2 sigurnosnom čipu.