Escolha Arquivo > Novo (no menu Arquivo, na parte superior da tela), e clique duas vezes no tema personalizado que deseja usar como base para o novo tema.
Os temas personalizados aparecem na categoria Meus Temas no seletor de temas. Caso queira usar um tema personalizado que não esteja aparecendo ali, é preciso antes instalar o tema personalizado (veja as instruções acima).
Faça as alterações, escolha Arquivo > Salvar Tema e, em seguida, escolha uma opção para salvar a apresentação como um novo tema.
O tema editado é salvo como uma nova versão. Você pode renomear a nova versão e apagar a primeira, se não desejar mantê-la.
Se você tiver uma sessão iniciada com a mesma Conta Apple em todos os seus dispositivos e o Usar o Finder para transferir apresentações do Keynote